Cada lenguaje de programación es más útil o menos según lo que queramos programar. No obstante, en términos generales, se puede evaluar si los programas implementados con un lenguaje ejecutan más rápidamente que los implementados con otro lenguaje. En esta página se analiza un buen conjunto de lenguajes y su rendimiento en diversos contextos. En este artículo se analiza el rendimiento de seis de los lenguajes más usados para su aplicación en bioinformática. Yo utilizo fundamentalmente Java, pero para operaciones intensivas de fácil implementación lo suyo es C (aunque sin hilos desmerece, habría que usar OpenMP y utilizar la GPU). Python es un lenguaje muy muy interesante por su versatilidad y facilidad, pero es, junto a Perl, de los más lentos. De hecho, para Python, al igual que para Java y Perl, existen librerías específicas para bioinformática.
sábado, 31 de marzo de 2012
lunes, 5 de diciembre de 2011
GnuPlot en Mac OS X
Para hacer funcionar GnuPlot y poder crear gráficas de todo tipo en formato EPS en Mac OS X basta seguir las indicaciones publicadas aquí. En resumen:
- ./configure -disable-wxwidgets
- make
- sudo make install
miércoles, 14 de septiembre de 2011
¿Cómo hacer una estancia de investigación en el extranjero?
Las estancias de investigación en centros del extranjero tienen por objetivo facilitar la realización de trabajos de investigación en centros especializados, actualizar conocimientos y adquirir técnicas de interés actual no disponibles en tu centro de trabajo habitual.
Para realizar una, lo primero es elegir el lugar de destino. Debe ser un centro de investigación lo más relevante posible conforme a la investigación que se pretende realizar y apropiado según tu director de tesis. También es muy interesante que algún miembro de tu grupo de investigación tenga algún contacto con el responsable del centro de destino. Una vez seleccionado dicho centro, escribir email al responsable del mismo y, si él está de acuerdo, enviará una carta de aceptación por email indicando que acepta tu visita durante un periodo determinado bajo unas condiciones que se especifican.
Lo siguiente es pedir ayudas para la estancia a organismos como la universidad en la que trabajas o, por ejemplo en el caso de Andalucía, a la Junta de Andalucía. Para la ayuda de la universidad (Plan propio) quizás tengan plazos para solicitar la ayuda. En el caso de la UPO, se puede solicitar en cualquier momento, pero dicha ayuda será resulta en los meses de enero o junio. Para esta ayuda es necesario redactar una memoria en la que se indiquen las actividades a realizar, el interés y la oportunidad de la
estancia. En la memoria también debe constar la conformidad de tu director de tesis. También piden un CV actualizado, la carta de aceptación del centro destino y rellenar un impreso de solicitud.
En el caso de la ayuda de la Junta de Andalucía, es necesaria también la memoria, tener el CV actualizado en SICA y según el tipo de perfil que tengas en tu centro de trabajo, te pueden pedir otros documentos. Por ejemplo, si eres personal investigador en formación financiado por la CEIC, te piden una autorización del Vicerrector, con el visto bueno del director de la beca, además de la carta de aceptación del centro destino.
Se puede pedir, en principio, el número de ayudas que se desee, por si no te conceden una poder tener otra de otro organismo.
También es necesario solicitar una comisión de servicios por el periodo que se va a estar de estancia, no para que te paguen facturas, sino para declarar de manera oficial dónde estás por si ocurre algo o se necesita justificar cualquier cosa.
Todo esto previo a la estancia. Durante la estancia, pues aprovechar el tiempo para aprender sobre tu tema de investigación, participar activamente en algún desarrollo de interés mutuo pero no tener la iniciativa sobre esto, por cortesía (eres un invitado/a allí). Y si es posible, conseguir publicar algún artículo en colaboración (a ser posible en revista con impacto).
A la vuelta de la estancia, se te puede pedir redactar una memoria con lo que has conseguido en el periodo de estancia. En el Plan propio de la UPO se te pide, por ejemplo.
Creo que no me he dejado nada atrás, eso es todo.
martes, 13 de septiembre de 2011
Convertir de PPT a HTML con PowerPoint 2010
En PowerPoint 2010 la función de convertir a HTML no existe en los menús, para convertir se puede hacer lo siguiente:
ActivePresentation.SaveAs "C:\users\(username)\desktop\(filename).htm", ppSaveAsHTML, msoFalse
5. Presionar ENTER.
lunes, 14 de marzo de 2011
Comparación de resultados
Ya que me dedico actualmente a producir artículos de investigación de índole informática y biológica, quisiera hablar sobre ello. Se trata de la comparación de resultados. Para que un artículo sea aceptado en una revista o en un congreso importante, es necesario que el método que se propone se pruebe, y en las mismas condiciones experimentales, con datos ya utilizados en otros artículos. De esta forma, se puede saber en qué medida es mejor el nuevo método que se presenta. Si esto hubiera sido siempre así, dentro de un mismo problema, todos los métodos propuestos para resolverlo utilizarían los mismos datos. Pero esto en la realidad no ocurre, con lo cual han habido muchos artículos que prueban sus métodos con datos no utilizados previamente. No obstante, en un principio, lo importante son los algoritmos, no los datos, por lo que lo ideal es utilizar siempre los mismos datos para validar los algoritmos que intentan resolver un mismo problema.
sábado, 12 de marzo de 2011
iPad
Voy a dedicar esta entrada de mi blog a hablar de la utilidad que tendría para mí un iPad de Apple. Voy a añadir enlaces a aquellos complementos y programas que me podrían ser útiles si tuviera un iPad.
Un iPad me puede servir para la música: para la composición musical (en casa o en el tren por ejemplo) y para tocar en directo o en los ensayos, los cuales tengo todas las semanas desde hace dos años.
Aparte de la música, me puede servir para leer (ya que tiene muy buen tamaño de pantalla y es de calidad): leer artículos de investigación para mi Tesis, leer libros, documentos, páginas web...
También me puede servir para enseñar algo a alguien: resultados e informes a mi director de Tesis en las reuniones, fotos y vídeos a amigos...
También para hacer las video-composiciones (edición de video con fotos, videos, música, texto, transiciones y efectos en una línea temporal) que tanto me gusta hacer de mis viajes y enseñarlas a mis amigos en un TV HD sin necesidad de producir la película final ni grabarla en DVD (sin retrasos ni saltos en la imagen, con calidad HD y al instante).
También me puede servir para la docencia: exponer una presentación con diapositivas conectando el iPad a un proyector, exponer cualquier documento o página web...
También me puede servir para jugar algo, aunque no creo que juegue mucho: para ocio, prefiero componer música.
Para ilustrar éstas y otras utilidades del iPad, pueden verse esta serie de videos autoexplicativos oficiales de algunas de las utilidades de un iPad.
Música con el iPad
- El iPad y las nuevas formas de creación musical
- Utilizar el iPad con iRig (adaptador 49.95€) y AmpliTube (software 15.99€) para tocar la guitarra eléctrica/bajo:
- Video explicativo en español sobre cómo utilizar el iPad con iRig y AmpliTube para tocar la guitarra eléctrica
- Video trailer del iRig
- Lugar de Apple.com donde adquirir iRig
- Web oficial de iRig y AmpliTube
- Utilizar el iPad con Apogee JAM (más calidad de sonido, $99) y GarageBand (software más versátil) para tocar la guitarra eléctrica/bajo:
- Sujetar el iPad para las sesiones de ensayo y en directo
- Software para reproducir y trabajar con partituras/tablaturas
lunes, 29 de noviembre de 2010
Máster en Informática terminado!
Acabo de conocer mi última calificación, la del Trabajo Fin de Máster (sobresaliente) y ya tengo mi título de Máster en Ingeniería y Tecnología del Software por la Universidad de Sevilla en el Curso 2009/10.
Falta añadir el Trabajo Fin de Máster que tengo un Sobresaliente (9).
Ea, pues otra cosa hecha, lo próximo la Tesis Doctoral...
